Medina, N., Soto-Debrán, J.C., Seidel, D., Akyar, I., Badali, H., Barac, A., Bretagne, S., Cag, Y., Cassagne, C., Castro, C., Chakrabarti, A., Dannaoui, E., Cardozo, C., Garcia-Rodriguez, J., Guitard, J., Hamal, P., Hoenigl, M., Jagielski, T., Khodavaisy, S., Lo Cascio, G., Martínez-Rubio, M.C., Meletiadis, J., Muñoz, P., Ochman, E., Peláez, T., Perez-Ayala Balzola, A., Prattes, J., Roilides, E., Ruíz-Pérez de Pipaón, M., Stauf, R., Steinmann, J., Suárez-Barrenechea, A.I., Tejero, R., Trovato, L., Viñuela, L., Wongsuk, T., Żak, I., Zarrinfar, H., Lass-Flörl, C., Arikan-Akdagli, S., Alastruey-Izquierdo, A.  MixInYeast: A Multicenter study on mixed yeast infections. J. Fungi, 2020, 7:e13.

Krukowski, H., Bakuła, Z., Iskra, M., Olender, A., Bis-Wencel, H., Jagielski, T. The first outbreak of methicillin-resistant Staphylococcus aureus in dairy cattle in Poland with evidence of on-farm and intrahousehold transmission.   J. Dairy Sci., 2020, S0022-0302(20)30653-6.

Minias, A., Żukowska, L., Lach, J., Jagielski, T., Strapagiel, D., Kim, S.-Y., Koh, W.-J., Adam, H., Bittner, R., Truden, S., Žolnir-Dovč, M., Dziadek, J. Subspecies-specific sequence detection for differentiation of Mycobacterium abscessus complex. Sci. Rep., 2020, 10:e16415.

Bakuła, Z., Gromadka, R., Gawor, J., Siedlecki, P., Pomorski, J.J., Maciszewski, K., Gromadka, A., Karnkowska, A., Jagielski, T. Sequencing and analysis of the complete organellar genomes of Prototheca wickerhamii Front. Plant Sci., 2020, doi:10.3389/fpls.2020.01296.

Jagielski, T., Borówka, P., Bakuła, Z., Lach, J., Marciniak, B., Brzostek, A., Dziadek, J., Dziurzyński, M., Pennings, L., van Ingen, J., Žolnir-Dovč, M., Strapagiel, D. Genomic insights into the Mycobacterium kansasii complex: an update. Front Microbiol., 2020, 10:e2918.

Jagielski, T., Bakuła, Z., Gawor, J., Maciszewski, K., Kusber, W.-H. Dyląg, M., Nowakowska, J., Gromadka, R., Karnkowska, A. The genus Prototheca (Trebouxiophyceae, Chlorophyta) revisited: implications from molecular taxonomic studies. Algal Res., 2019, 43:e101639.

Dos Anjos, C., Sellera, F.P., Gargano, R.G., Lincopan, N., Pogliani, F.C., Ribeiro, M.G., Jagielski, T., Sabino, C.P. Algicidal effect of blue light on pathogenic Prototheca species. Photodiagnosis Photodyn. Ther., 2019, 26:210-213.

Jagielski, T., Krukowski, H., Bochniarz, M., Piech, T., Roeske, K., Bakuła, Z., Wlazło, Ł.,  Woch, P.   Prevalence of Prototheca spp. on dairy farms in Poland – a cross-country study. Microb. Biotechnol., 2019, 12:556-566.

Bakuła, Z., Javed, H., Pleń, M., Jamil, N., Tahir, Z., Jagielski, T. Genetic diversity of multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates in Punjab, Pakistan. Infect. Genet. Evol., 2019, doi: 10.1016/j.meegid.2019.02.029.

Jagielski, T., Roeske, K., Bakuła, Z., Piech, T., Wlazło, Ł., Bochniarz, M., Woch, P., Krukowski, H.  A survey on the incidence of Prototheca mastitis in dairy herds in Lublin province, Poland. J.Dairy Sci., 2019, 102:619-628.

Roeske, K., Stachowiak, R., Jagielski, T., Kamiński, M., Bielecki, J. Delivery of chicken egg ovalbumin to dendritic cells by listeriolysin O-secreting vegetative Bacillus subtilis. J. Microbiol. Biotechnol., 2018, 28(1):122-135.

Kordalewska, M., Kalita, J., Bakula, Z., Brillowska-Dabrowska, A., Jagielski, T. PCR-RFLP assays for species-specific identification of fungi belonging to Scopulariopsis and related genera. Med. Mycol., 2018, doi:10.1093/mmy/myy106.

Javed, H., Bakuła, Z., Pleń, M., Hashmi, H.J., Tahir, Z., Jamil, N., Jagielski, T. Evaluation of Genotype MTBDRplus and MTBDRsl assays for rapid detection of drug resistance in extensively drug-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates in Pakistan. Front. Microbiol., 2018, 9:2265.

Jagielski, T., Gawor, J., Bakuła, Z., Decewicz, P., Maciszewski, K., Karnkowska, A. cytb as a new genetic marker for differentiation of Prototheca species. J. Clin. Microbiol., 2018, pii:JCM.00584-18.

Jagielski, T., Bakuła, Z., Brzostek, A., Minias, A., Stachowiak, R., Kalita, J., Napiórkowska, A., Augustynowicz-Kopeć, E., Żaczek, A., Vasiliauskiene, E., Bielecki, J., Dziadek, J. Characterization of mutations conferring resistance to rifampin in Mycobacterium tuberculosis clinical strains. Antimicrob. Agents Chemother., 2018, 62:e01093-18.

Jagielski, T., Bakuła, Z., Pleń, M., Kamiński, M., Nowakowska, J., Bielecki, J., Wolska, K.I., Grudniak, A.M. The activity of silver nanoparticles against microalgae of the Prototheca genus. Nanomedicine, 2018, 13:1025-1036.

Bakuła, Z., Kościuch, J., Safianowska, A., Proboszcz, M., Bielecki, J., van Ingen, J., Krenke, R., Jagielski, T. Clinical, radiological and molecular features of Mycobacterium kansasii pulmonary disease. Respir. Med., 2018, 139:91-100.

Murugaiyan, J., Lewin, A., Kamal, E., Bakula, Z., van Ingen, J., Ulmann, V., Josebe Unzaga Barañano, M., Humięcka, J., Safianowska, A., Roesler, U., Jagielski, T. MALDI spectra database for rapid discrimination and subtyping of Mycobacterium kansasii. Front. Microbiol., 2018, 3:587.

Bakuła, Z., Brzostek, A., Borówka, P., Żaczek, A., Szulc-Kiełbik, I., Podpora, A., Parniewski, P., Strapagiel, D., Dziadek, J., Proboszcz, M., Bielecki, J., van Ingen, J., Jagielski, T. Molecular typing of Mycobacterium kansasii using pulsed-field gel electrophoresis and newly designed variable-number tandem repeat analysis. Sci. Rep., 2018, 8:4462.

Bakuła, Z., Modrzejewska, M., Pennings, L., Proboszcz, M., Safianowska, A., Bielecki, J., van Ingen, J., Jagielski, T. Drug susceptibility profiling and genetic determinants of drug resistance in Mycobacterium kansasii. Antimicrob. Agents Chemother., 2018, AAC.01788-17.

Jagielski, T., Gawor, J., Bakuła, Z., Zuchniewicz, K., Gromadka, R., Żak, I.  An optimized method for high quality DNA extraction from microalga Prototheca wickerhamii for genome sequencing.  Plant Meth., 2017, 13:77.

Jagielski, T., Dyląg, M., Roesler, U., Murugaiyan, J. Isolation of infectious microalga Prototheca wickerhamii from a carp (Cyprinus carpio) – a first confirmed case report of protothecosis in a fish. J. Fish Dis., 2017, 40:1417-1421.

Witkowska, E., Jagielski, T., Kowalska, A., Waluk, J., Hryncewicz-Gwóźdź, A., Kamińska, A. Detection and identification of human fungal pathogens using surface-enhanced Raman spectroscopy and principal component analysis. Anal. Methods, 2016, 8:8427-8434.

Dyląg, M., Hryncewicz-Gwóźdź, A., Jagielski, T. Onychomycosis due to Arthrinium arundinis – first case report. Acta Derm. Venereol., 2017, 97:860-861.

Alves, A.C., Capra, E., Morandi, S., Cremonesi, P., Pantoja, J. C., Langoni, H., de Vargas, A. P., da Costa, M.M., Jagielski, T., Bolaños, C. A., Guerra, S.T., Ribeiro, M. G. In vitro algicidal effect of guanidine on Prototheca zopfii genotype 2 strains isolated from clinical and subclinical bovine mastitis. Lett. Appl. Microbiol., 2017, 64:419-423.

Borówka, P., Lach, J., Bakuła, Z., van Ingen, J., Safianowska, A., Brzostek, A., Dziadek, J., Strapagiel, D., Jagielski, T. Draft genome sequences of Mycobacterium kansasii clinical strains. Genome Announc., 2017, 5: e00406-17.

Jagielski, T., Bakuła, Z., Di Mauro, S., Casciari, C., Cambiotti, V., Krukowski, H., Turchetti, B., Ricchi, M., Manuali, E., Buzzini, P. A comparative study of the in vitro activity of iodopropynyl 1 butylcarbamate (IPBC) and amphotericin B (AMB) against Prototheca spp. J. Dairy Sci., 2017, 100:7435-7445.

Kwiatkowska, A., Granicka, L.H., Grzeczkowicz, A., Stachowiak, R., Kamiński, M., Grubek, Z., Bielecki, J., Strawski, M., Szklarczyk, M. Stabilized nanosystem of nanocarriers with an immobilized biological factor for anti-tumor therapy. PloS One, 2017, 12:e0170925.

Strapagiel, D., Borówka, P., Marciniak, B., Bakuła, Z., van Ingen, J., Safianowska, A., Brzostek, A., Dziadek, J., Jagielski, T.  Draft genome sequences of Mycobacterium kansasii strains 1010001454, 1010001458, 1010001468, 1010001493, 1010001495, and 1010001469, isolated from environmental sources. Genome Announc., 2016, 4:e00456-16.

Kordalewska, M., Jagielski, T., Brillowska-Dąbrowska A. Rapid assays for specific detection of fungi of Scopulariopsis and Microascus genera and Scopulariopsis brevicaulis species. Mycopathologia, 2016, 181:465-474.

Bakuła, Z., Napiórkowska, A., Kamiński, M., Augustynowicz-Kopeć, E., Zwolska, Z., Bielecki, J., Jagielski, T.  Second-line anti-tuberculosis drug resistance and its genetic determinants in multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis clinical isolates. J. Microbiol. Immunol. Infect., 2016, 49(3), 439-444. J. Microbiol. Immunol. Infect., 2016, 49:439-444.

Jagielski, T., Sandoval-Denis, M., Yu, J., Yao, L., Bakuła, Z., Kalita, J., Skóra, M., Krzyściak, P., de Hoog, G.S., Guarro, J., Gené, J. Molecular taxonomy of scopulariopsis-like fungi with description of new clinical and environmental species. Fungal Biol., 2016, 120:586-602.

Hryncewicz-Gwózdź, A., Wojciechowska-Zdrojowy, M., Maj, J., Baran, W., Jagielski, T. Paradoxical reaction during a course of terbinafine treatment of Trichophyton interdigitale infection in a child. JAMA Dermatol., 2016, 152:342-343.

Bakuła, Z., Modrzejewska, M., Safianowska, A., van Ingen, J., Proboszcz, M., Bielecki, J., Jagielski, T. Proposal of a new method for subtyping of Mycobacterium kansasii based upon PCR restriction enzyme analysis of the tuf gene. Diagn. Microbiol. Infect. Dis., 2016, 84:318-321.